Materialsammlungen, Entwürfe, Notizen unterschiedlichen Charakters - teils im Rahmen von Publikationsvorhaben, teils für den privaten Gebrauch bestimmt - und Exzerpte aus Büchern verschiedenster Fachrichtungen, gesammelt in 28 Bänden in der Bibliothèque Nationale in Paris, in der Bibliothèque Universitaire Historique de Médecine in Montpellier, in der Società La Colombaria in Florenz, in der Hamburger Staats- und Universitätsbibliothek Carl von Ossietzky, in der Biblioteca Nazionale Centrale di Roma und in der Accademia Rubiconia dei Filopatridi in Savignano sowie in verstreuten Heften und Blättern machen den handschriftlichen Nachlass Winckelmanns aus und geben Einblick in seine Arbeitsweise und die Entstehungsgeschichte seiner Publikationen. Hier wird ein thematischer Überblick geboten, gegliedert in Vorarbeiten zu den Publikationsvorhaben Winckelmanns, unterteilt in vom Verfasser verworfene und realisierte Vorhaben, in Entwürfe zu von ihm publizierten Schriften sowie zu seinen post mortem herausgegebenen bzw. unpublizierten Schriften, in Materialien zu Italien mit Notizen zu Bibliotheken in Rom und Italien, zu Akademien und Kunstsammlungen und zur Landeskunde, in Dokumente, Biographica und in Exzerpte aus Büchern und Zeitschriften. Noch nicht Publiziertes ist zum Teil transkribiert abgedruckt, auf bereits anderswo abgedruckte Vorarbeiten und Entwürfe wird verwiesen.